Quirigua se trouvait jadis au bord du fleuve Motagua. Le lit de ce cours d'eau se trouve maintenant à 1 km au Sud du groupe principal du site.
, fut longtemps sous la domination de Copan, mais à partir de 737 elle devint sa rivale. En effet, Quirigua était la vassale la plus importante de Copan, elle contrôlait l'accès stratégique aux itinéraires commerciaux et aux ressources minérales du roi Motahua.
Quand elles entrèrent en conflit, K'ak' Tiliw Chan Yoaat alias "Cauac-Ciel" captura "18 Lapins", roi de Copan, et le décapita. Pas de grandes pyramides sur le plus petit site maya, mais onze stèles dont les plus hautes au monde, à la gloire du souverain Cauac-Ciel et quatre roches sculptées et taillées en forme d'animaux mythologiques (zoomorphie).
l'UNESCO a déclaré Quirigua Héritage Culturel d'Humanité.
